Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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RAB40BQ12829 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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RAB40BQ12829 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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RAB40BQ12829 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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RAB40BQ12829 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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RAB40BQ12829 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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RAB40BQ12829 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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RAB40BQ12829 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
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RAB40BQ12829 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
RAB40BQ12829 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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