Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GOLGA3Q08378 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms