Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GABPAQ06546 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GABPAQ06546 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms