Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PTPN12Q05209 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PTPN12Q05209 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms