Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUCB1Q02818 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUCB1Q02818 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms