Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ID3Q02535 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ID3Q02535 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ID3Q02535 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ID3Q02535 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ID3Q02535 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
ID3Q02535 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ID3Q02535 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ID3Q02535 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ID3Q02535 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ID3Q02535 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ID3Q02535 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ID3Q02535 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ID3Q02535 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ID3Q02535 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ID3Q02535 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
ID3Q02535 SULT1A1-211ENST00000569554 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ID3Q02535 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
ID3Q02535 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ID3Q02535 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ID3Q02535 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ID3Q02535 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ID3Q02535 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ID3Q02535 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ID3Q02535 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ID3Q02535 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ID3Q02535 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ID3Q02535 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ID3Q02535 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ID3Q02535 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ID3Q02535 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ID3Q02535 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ID3Q02535 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms