Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CDK17Q00537 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms