Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IFI35P80217 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IFI35P80217 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
IFI35P80217 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
IFI35P80217 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFI35P80217 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFI35P80217 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFI35P80217 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFI35P80217 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFI35P80217 PAM-201ENST00000304400 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFI35P80217 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFI35P80217 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFI35P80217 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFI35P80217 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFI35P80217 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFI35P80217 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFI35P80217 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFI35P80217 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFI35P80217 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFI35P80217 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IFI35P80217 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFI35P80217 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFI35P80217 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFI35P80217 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IFI35P80217 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IFI35P80217 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IFI35P80217 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFI35P80217 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFI35P80217 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IFI35P80217 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IFI35P80217 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFI35P80217 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFI35P80217 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFI35P80217 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFI35P80217 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFI35P80217 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
IFI35P80217 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFI35P80217 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFI35P80217 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFI35P80217 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFI35P80217 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFI35P80217 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFI35P80217 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFI35P80217 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFI35P80217 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFI35P80217 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFI35P80217 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFI35P80217 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IFI35P80217 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFI35P80217 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFI35P80217 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFI35P80217 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IFI35P80217 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFI35P80217 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFI35P80217 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFI35P80217 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFI35P80217 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFI35P80217 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFI35P80217 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFI35P80217 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFI35P80217 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFI35P80217 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFI35P80217 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFI35P80217 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFI35P80217 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFI35P80217 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFI35P80217 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFI35P80217 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFI35P80217 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFI35P80217 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFI35P80217 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFI35P80217 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFI35P80217 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IFI35P80217 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFI35P80217 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFI35P80217 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFI35P80217 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFI35P80217 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFI35P80217 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IFI35P80217 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFI35P80217 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFI35P80217 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFI35P80217 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFI35P80217 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFI35P80217 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFI35P80217 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFI35P80217 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFI35P80217 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFI35P80217 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFI35P80217 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFI35P80217 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IFI35P80217 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFI35P80217 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFI35P80217 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFI35P80217 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFI35P80217 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFI35P80217 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFI35P80217 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFI35P80217 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IFI35P80217 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms