Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
RPL23P62829 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPL23P62829 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPL23P62829 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPL23P62829 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPL23P62829 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPL23P62829 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPL23P62829 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPL23P62829 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPL23P62829 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
RPL23P62829 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPL23P62829 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPL23P62829 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPL23P62829 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPL23P62829 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPL23P62829 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPL23P62829 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPL23P62829 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPL23P62829 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPL23P62829 NFATC2-207ENST00000610033 2740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPL23P62829 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPL23P62829 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPL23P62829 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPL23P62829 GOLGA6L10-209ENST00000621197 4160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPL23P62829 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPL23P62829 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
RPL23P62829 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
RPL23P62829 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
RPL23P62829 KIF1A-213ENST00000498729 9221 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
RPL23P62829 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
RPL23P62829 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
RPL23P62829 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPL23P62829 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPL23P62829 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPL23P62829 TGFBR3-201ENST00000212355 6465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPL23P62829 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPL23P62829 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPL23P62829 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPL23P62829 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPL23P62829 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPL23P62829 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPL23P62829 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPL23P62829 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPL23P62829 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPL23P62829 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPL23P62829 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPL23P62829 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPL23P62829 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPL23P62829 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPL23P62829 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPL23P62829 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPL23P62829 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPL23P62829 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPL23P62829 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPL23P62829 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPL23P62829 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPL23P62829 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPL23P62829 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPL23P62829 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPL23P62829 TWSG1-201ENST00000262120 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPL23P62829 DMTN-220ENST00000523266 2735 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPL23P62829 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPL23P62829 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPL23P62829 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPL23P62829 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPL23P62829 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPL23P62829 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPL23P62829 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPL23P62829 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPL23P62829 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPL23P62829 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPL23P62829 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPL23P62829 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPL23P62829 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPL23P62829 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPL23P62829 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPL23P62829 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPL23P62829 BAHD1-203ENST00000561234 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPL23P62829 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPL23P62829 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPL23P62829 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPL23P62829 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPL23P62829 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPL23P62829 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPL23P62829 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPL23P62829 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPL23P62829 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPL23P62829 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPL23P62829 WASHC2A-209ENST00000611324 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPL23P62829 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPL23P62829 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPL23P62829 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPL23P62829 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPL23P62829 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPL23P62829 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPL23P62829 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPL23P62829 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPL23P62829 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPL23P62829 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPL23P62829 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms