Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
POLR2FP61218 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2FP61218 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms