Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 CIITA-213ENST00000618327 4657 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FAM3BP58499 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 POTEE-201ENST00000356920 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FAM3BP58499 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms