Protein–RNA interactions for Protein: P54852

EMP3, Epithelial membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP3P54852 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EMP3P54852 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EMP3P54852 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EMP3P54852 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EMP3P54852 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EMP3P54852 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EMP3P54852 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EMP3P54852 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
EMP3P54852 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
EMP3P54852 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 LYG1-201ENST00000308528 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 MGST3-204ENST00000367888 778 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 LHFPL3-AS1-202ENST00000416376 866 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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EMP3P54852 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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EMP3P54852 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 AC007066.2-202ENST00000566531 914 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 AP000919.3-201ENST00000582591 568 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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EMP3P54852 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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EMP3P54852 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
EMP3P54852 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EMP3P54852 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EMP3P54852 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EMP3P54852 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EMP3P54852 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EMP3P54852 LINC00570-201ENST00000417473 1330 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EMP3P54852 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EMP3P54852 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EMP3P54852 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EMP3P54852 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EMP3P54852 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
EMP3P54852 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EMP3P54852 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EMP3P54852 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EMP3P54852 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EMP3P54852 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
EMP3P54852 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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