Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
MTHFRP42898 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms