Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
DDIT3P35638 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms