Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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HOXD12P35452 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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HOXD12P35452 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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HOXD12P35452 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
HOXD12P35452 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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