Protein–RNA interactions for Protein: P35321

SPRR1A, Cornifin-A, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR1AP35321 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
SPRR1AP35321 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms