Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HOXA7P31268 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
HOXA7P31268 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.3 ms