Protein–RNA interactions for Protein: P29120

PCSK1, Neuroendocrine convertase 1, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1P29120 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCSK1P29120 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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