Protein–RNA interactions for Protein: P28360

MSX1, Homeobox protein MSX-1, humanhuman

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Length 303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSX1P28360 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MSX1P28360 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MSX1P28360 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MSX1P28360 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MSX1P28360 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MSX1P28360 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MSX1P28360 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MSX1P28360 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MSX1P28360 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MSX1P28360 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MSX1P28360 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MSX1P28360 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MSX1P28360 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
MSX1P28360 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MSX1P28360 AC010181.2-201ENST00000483759 482 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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MSX1P28360 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MSX1P28360 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MSX1P28360 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MSX1P28360 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MSX1P28360 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MSX1P28360 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MSX1P28360 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MSX1P28360 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MSX1P28360 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
MSX1P28360 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MSX1P28360 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MSX1P28360 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MSX1P28360 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MSX1P28360 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MSX1P28360 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MSX1P28360 CACNA1C-211ENST00000399617 7482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MSX1P28360 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MSX1P28360 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MSX1P28360 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MSX1P28360 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MSX1P28360 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MSX1P28360 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MSX1P28360 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MSX1P28360 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MSX1P28360 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
MSX1P28360 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
MSX1P28360 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSX1P28360 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSX1P28360 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSX1P28360 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSX1P28360 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSX1P28360 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSX1P28360 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSX1P28360 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSX1P28360 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSX1P28360 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSX1P28360 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSX1P28360 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSX1P28360 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSX1P28360 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSX1P28360 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSX1P28360 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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MSX1P28360 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSX1P28360 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSX1P28360 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSX1P28360 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSX1P28360 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSX1P28360 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSX1P28360 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSX1P28360 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSX1P28360 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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MSX1P28360 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSX1P28360 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSX1P28360 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSX1P28360 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSX1P28360 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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MSX1P28360 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSX1P28360 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSX1P28360 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
MSX1P28360 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSX1P28360 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSX1P28360 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
MSX1P28360 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSX1P28360 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSX1P28360 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSX1P28360 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSX1P28360 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSX1P28360 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSX1P28360 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
MSX1P28360 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSX1P28360 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSX1P28360 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSX1P28360 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSX1P28360 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSX1P28360 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSX1P28360 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSX1P28360 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSX1P28360 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSX1P28360 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSX1P28360 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
MSX1P28360 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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