Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NTF3P20783 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NTF3P20783 SHANK2-218ENST00000601538 9062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NTF3P20783 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NTF3P20783 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NTF3P20783 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NTF3P20783 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NTF3P20783 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NTF3P20783 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NTF3P20783 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NTF3P20783 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NTF3P20783 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NTF3P20783 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NTF3P20783 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NTF3P20783 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NTF3P20783 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NTF3P20783 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NTF3P20783 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NTF3P20783 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NTF3P20783 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NTF3P20783 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NTF3P20783 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NTF3P20783 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NTF3P20783 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NTF3P20783 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NTF3P20783 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NTF3P20783 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NTF3P20783 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NTF3P20783 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NTF3P20783 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NTF3P20783 AC011481.3-201ENST00000623895 5594 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NTF3P20783 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
NTF3P20783 ST3GAL2-202ENST00000393640 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NTF3P20783 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NTF3P20783 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NTF3P20783 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NTF3P20783 FAM237B-201ENST00000637645 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NTF3P20783 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NTF3P20783 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NTF3P20783 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
NTF3P20783 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NTF3P20783 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NTF3P20783 TMEM56-201ENST00000370203 6822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NTF3P20783 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NTF3P20783 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NTF3P20783 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NTF3P20783 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
NTF3P20783 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 PRKCE-201ENST00000306156 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 RBM19-201ENST00000261741 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 CAMK2A-201ENST00000348628 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 ST8SIA1-203ENST00000396037 9714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 PDXK-201ENST00000291565 7366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 ITGAX-201ENST00000268296 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NTF3P20783 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms