Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFE3P19532 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFE3P19532 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFE3P19532 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFE3P19532 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFE3P19532 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TFE3P19532 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TFE3P19532 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFE3P19532 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFE3P19532 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFE3P19532 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFE3P19532 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TFE3P19532 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFE3P19532 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFE3P19532 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TFE3P19532 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFE3P19532 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TFE3P19532 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TFE3P19532 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TFE3P19532 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TFE3P19532 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFE3P19532 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFE3P19532 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFE3P19532 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFE3P19532 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFE3P19532 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFE3P19532 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFE3P19532 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFE3P19532 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFE3P19532 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFE3P19532 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFE3P19532 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFE3P19532 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFE3P19532 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFE3P19532 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFE3P19532 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TFE3P19532 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TFE3P19532 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFE3P19532 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFE3P19532 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFE3P19532 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFE3P19532 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFE3P19532 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFE3P19532 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFE3P19532 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFE3P19532 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFE3P19532 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFE3P19532 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFE3P19532 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFE3P19532 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFE3P19532 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFE3P19532 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFE3P19532 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFE3P19532 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFE3P19532 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFE3P19532 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFE3P19532 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFE3P19532 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFE3P19532 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFE3P19532 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFE3P19532 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TFE3P19532 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFE3P19532 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFE3P19532 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFE3P19532 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFE3P19532 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFE3P19532 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFE3P19532 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFE3P19532 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFE3P19532 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFE3P19532 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFE3P19532 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFE3P19532 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFE3P19532 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFE3P19532 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFE3P19532 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TFE3P19532 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFE3P19532 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFE3P19532 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFE3P19532 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFE3P19532 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFE3P19532 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TFE3P19532 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFE3P19532 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFE3P19532 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFE3P19532 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFE3P19532 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFE3P19532 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFE3P19532 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TFE3P19532 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TFE3P19532 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TFE3P19532 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TFE3P19532 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TFE3P19532 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TFE3P19532 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TFE3P19532 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TFE3P19532 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TFE3P19532 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TFE3P19532 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TFE3P19532 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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