Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 TAB1-201ENST00000216160 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TRIM21P19474 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms