Protein–RNA interactions for Protein: P18085

ARF4, ADP-ribosylation factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF4P18085 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ARF4P18085 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF4P18085 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF4P18085 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF4P18085 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF4P18085 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF4P18085 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF4P18085 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF4P18085 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF4P18085 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF4P18085 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF4P18085 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF4P18085 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF4P18085 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF4P18085 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF4P18085 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF4P18085 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF4P18085 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF4P18085 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF4P18085 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF4P18085 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF4P18085 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF4P18085 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF4P18085 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF4P18085 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF4P18085 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF4P18085 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF4P18085 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF4P18085 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF4P18085 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF4P18085 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF4P18085 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF4P18085 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF4P18085 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF4P18085 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ARF4P18085 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF4P18085 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF4P18085 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF4P18085 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF4P18085 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF4P18085 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF4P18085 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF4P18085 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF4P18085 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF4P18085 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF4P18085 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF4P18085 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF4P18085 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF4P18085 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF4P18085 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF4P18085 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF4P18085 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF4P18085 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF4P18085 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF4P18085 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF4P18085 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF4P18085 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF4P18085 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF4P18085 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF4P18085 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF4P18085 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF4P18085 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF4P18085 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF4P18085 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF4P18085 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF4P18085 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF4P18085 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF4P18085 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF4P18085 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF4P18085 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF4P18085 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF4P18085 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF4P18085 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF4P18085 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ARF4P18085 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF4P18085 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF4P18085 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF4P18085 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF4P18085 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF4P18085 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF4P18085 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF4P18085 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF4P18085 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF4P18085 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF4P18085 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF4P18085 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF4P18085 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF4P18085 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF4P18085 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF4P18085 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF4P18085 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF4P18085 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF4P18085 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF4P18085 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF4P18085 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF4P18085 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF4P18085 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF4P18085 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF4P18085 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ARF4P18085 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms