Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATP2A2P16615 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms