Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
VAV1P15498 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAV1P15498 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAV1P15498 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAV1P15498 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
VAV1P15498 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAV1P15498 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAV1P15498 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAV1P15498 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAV1P15498 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAV1P15498 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAV1P15498 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAV1P15498 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAV1P15498 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAV1P15498 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAV1P15498 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAV1P15498 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAV1P15498 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAV1P15498 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAV1P15498 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAV1P15498 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAV1P15498 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAV1P15498 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAV1P15498 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAV1P15498 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAV1P15498 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAV1P15498 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VAV1P15498 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAV1P15498 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAV1P15498 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAV1P15498 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAV1P15498 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAV1P15498 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAV1P15498 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAV1P15498 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAV1P15498 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAV1P15498 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
VAV1P15498 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAV1P15498 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAV1P15498 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAV1P15498 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAV1P15498 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAV1P15498 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAV1P15498 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAV1P15498 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAV1P15498 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAV1P15498 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAV1P15498 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAV1P15498 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAV1P15498 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAV1P15498 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAV1P15498 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAV1P15498 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAV1P15498 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
VAV1P15498 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAV1P15498 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAV1P15498 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VAV1P15498 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAV1P15498 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAV1P15498 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAV1P15498 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAV1P15498 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAV1P15498 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAV1P15498 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAV1P15498 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAV1P15498 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAV1P15498 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAV1P15498 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAV1P15498 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAV1P15498 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAV1P15498 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAV1P15498 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAV1P15498 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VAV1P15498 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAV1P15498 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAV1P15498 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAV1P15498 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAV1P15498 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAV1P15498 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VAV1P15498 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAV1P15498 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAV1P15498 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAV1P15498 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAV1P15498 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VAV1P15498 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAV1P15498 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAV1P15498 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAV1P15498 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAV1P15498 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAV1P15498 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAV1P15498 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
VAV1P15498 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAV1P15498 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAV1P15498 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
VAV1P15498 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAV1P15498 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAV1P15498 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAV1P15498 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAV1P15498 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
VAV1P15498 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms