Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TNNT1P13805 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms