Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HOXD8P13378 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXD8P13378 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms