Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
PGA3P0DJD8 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
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