Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TPM2P07951 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TPM2P07951 TFIP11-201ENST00000405938 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TPM2P07951 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TPM2P07951 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPM2P07951 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPM2P07951 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPM2P07951 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPM2P07951 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPM2P07951 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPM2P07951 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPM2P07951 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPM2P07951 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPM2P07951 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPM2P07951 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPM2P07951 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPM2P07951 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPM2P07951 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPM2P07951 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPM2P07951 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPM2P07951 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPM2P07951 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPM2P07951 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPM2P07951 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPM2P07951 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPM2P07951 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPM2P07951 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPM2P07951 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPM2P07951 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPM2P07951 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPM2P07951 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPM2P07951 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPM2P07951 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPM2P07951 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPM2P07951 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPM2P07951 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPM2P07951 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TPM2P07951 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TPM2P07951 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPM2P07951 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPM2P07951 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPM2P07951 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPM2P07951 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPM2P07951 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPM2P07951 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPM2P07951 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPM2P07951 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPM2P07951 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPM2P07951 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPM2P07951 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPM2P07951 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPM2P07951 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPM2P07951 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TPM2P07951 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPM2P07951 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPM2P07951 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPM2P07951 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPM2P07951 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPM2P07951 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPM2P07951 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPM2P07951 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TPM2P07951 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TPM2P07951 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPM2P07951 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPM2P07951 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPM2P07951 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPM2P07951 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPM2P07951 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPM2P07951 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPM2P07951 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPM2P07951 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPM2P07951 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPM2P07951 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPM2P07951 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPM2P07951 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPM2P07951 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPM2P07951 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPM2P07951 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPM2P07951 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPM2P07951 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPM2P07951 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TPM2P07951 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TPM2P07951 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TPM2P07951 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TPM2P07951 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TPM2P07951 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TPM2P07951 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TPM2P07951 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TPM2P07951 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TPM2P07951 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TPM2P07951 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TPM2P07951 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TPM2P07951 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TPM2P07951 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TPM2P07951 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TPM2P07951 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TPM2P07951 CNGA3-204ENST00000409937 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TPM2P07951 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TPM2P07951 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TPM2P07951 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms