Protein–RNA interactions for Protein: O95045

UPP2, Uridine phosphorylase 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP2O95045 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPP2O95045 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPP2O95045 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
UPP2O95045 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPP2O95045 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPP2O95045 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPP2O95045 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPP2O95045 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPP2O95045 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPP2O95045 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPP2O95045 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPP2O95045 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPP2O95045 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPP2O95045 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPP2O95045 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPP2O95045 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPP2O95045 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPP2O95045 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPP2O95045 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPP2O95045 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPP2O95045 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPP2O95045 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPP2O95045 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPP2O95045 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPP2O95045 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPP2O95045 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPP2O95045 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPP2O95045 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPP2O95045 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UPP2O95045 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
UPP2O95045 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPP2O95045 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPP2O95045 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPP2O95045 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPP2O95045 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPP2O95045 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPP2O95045 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPP2O95045 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPP2O95045 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPP2O95045 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
UPP2O95045 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
UPP2O95045 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
UPP2O95045 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
UPP2O95045 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
UPP2O95045 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
UPP2O95045 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
UPP2O95045 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
UPP2O95045 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UPP2O95045 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UPP2O95045 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UPP2O95045 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UPP2O95045 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UPP2O95045 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UPP2O95045 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UPP2O95045 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UPP2O95045 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UPP2O95045 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UPP2O95045 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UPP2O95045 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UPP2O95045 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UPP2O95045 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UPP2O95045 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UPP2O95045 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UPP2O95045 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UPP2O95045 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UPP2O95045 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UPP2O95045 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UPP2O95045 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UPP2O95045 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UPP2O95045 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UPP2O95045 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UPP2O95045 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UPP2O95045 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UPP2O95045 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UPP2O95045 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UPP2O95045 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UPP2O95045 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UPP2O95045 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UPP2O95045 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UPP2O95045 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UPP2O95045 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UPP2O95045 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UPP2O95045 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UPP2O95045 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UPP2O95045 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
UPP2O95045 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UPP2O95045 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UPP2O95045 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UPP2O95045 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UPP2O95045 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UPP2O95045 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UPP2O95045 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UPP2O95045 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UPP2O95045 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UPP2O95045 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UPP2O95045 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UPP2O95045 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UPP2O95045 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
UPP2O95045 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
UPP2O95045 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms