Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QRK9 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QRK9 KRT17P5-202ENST00000444070 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QRK9 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QRK9 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QRK9 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QRK9 ZBED8-201ENST00000408953 2851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QRK9 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QRK9 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QRK9 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QRK9 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QRK9 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QRK9 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QRK9 TMPRSS13-202ENST00000445164 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QRK9 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QRK9 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QRK9 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QRK9 C10orf90-202ENST00000356858 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QRK9 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QRK9 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
J3QRK9 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QRK9 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QRK9 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QRK9 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QRK9 DNM1-213ENST00000628346 3835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QRK9 FAM102A-202ENST00000373084 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QRK9 MED15-204ENST00000406969 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QRK9 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QRK9 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QRK9 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QRK9 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QRK9 GUCY1B3-204ENST00000505154 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QRK9 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QRK9 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QRK9 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QRK9 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QRK9 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QRK9 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QRK9 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QRK9 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QRK9 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QRK9 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QRK9 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QRK9 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QRK9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QRK9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QRK9 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QRK9 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QRK9 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QRK9 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QRK9 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QRK9 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QRK9 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QRK9 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QRK9 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QRK9 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QRK9 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QRK9 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QRK9 ACTR3-201ENST00000263238 6718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QRK9 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QRK9 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QRK9 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QRK9 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QRK9 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QRK9 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QRK9 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QRK9 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QRK9 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QRK9 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QRK9 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QRK9 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QRK9 FLT4-212ENST00000619105 3806 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QRK9 ZFYVE27-205ENST00000370613 2669 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QRK9 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QRK9 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QRK9 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QRK9 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QRK9 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QRK9 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QRK9 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QRK9 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
J3QRK9 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
J3QRK9 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
J3QRK9 DGKA-202ENST00000394147 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
J3QRK9 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
J3QRK9 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
J3QRK9 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
J3QRK9 ICOSLG-203ENST00000400379 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
J3QRK9 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
J3QRK9 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
J3QRK9 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
J3QRK9 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
J3QRK9 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
J3QRK9 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
J3QRK9 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
J3QRK9 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
J3QRK9 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
J3QRK9 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
J3QRK9 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
J3QRK9 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms