Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
LINC01387J3KSC0 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms