Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 HK2P1-201ENST00000447818 2737 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 RNF165-202ENST00000543885 4852 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 SLC2A5-202ENST00000377424 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 RGL4-202ENST00000401461 2420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 SEMA4D-212ENST00000450295 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 SLC45A4-202ENST00000517878 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 AC105402.3-202ENST00000446781 2592 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 SLC45A4-201ENST00000024061 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 AC008609.1-202ENST00000501818 2686 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 SLC18A1-204ENST00000437980 2822 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 PLXNA1-201ENST00000393409 9066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 AC010969.1-201ENST00000340444 2412 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 PAM-204ENST00000348126 3622 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 CAV1-209ENST00000614113 3201 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 ZNF572-201ENST00000319286 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 MAN2C1-224ENST00000565683 3300 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 ENOSF1-203ENST00000383578 4188 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 ITGB6-204ENST00000409967 2292 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 MICA-210ENST00000616296 2260 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 HERC6-203ENST00000380265 3781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 ZNF266-206ENST00000592292 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 HGNC:18790-209ENST00000513555 3291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 PAFAH1B2-204ENST00000527958 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 L1CAM-201ENST00000361699 3888 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 PRMT7-201ENST00000339507 4238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 SOX13-203ENST00000367204 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 PIGC-202ENST00000367728 2630 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 ZNF606-204ENST00000547828 2680 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 PDE4C-206ENST00000594465 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 ENOX2-204ENST00000394363 4174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 NR2E1-201ENST00000368983 2612 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 TOMM40L-202ENST00000367988 2708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 TECTB-201ENST00000369422 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 MAP2K6-206ENST00000590474 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 RSPH10B2-201ENST00000297186 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 RSPH10B-201ENST00000337579 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 HDAC7-230ENST00000552960 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
VGLL3A8MV65 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms