Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 FAM189A2-204ENST00000455972 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 PANX2-202ENST00000395842 3051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CFAP73A6NFT4 DLX3-201ENST00000434704 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 MEG3-213ENST00000455531 4867 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 TRPV1-206ENST00000571088 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 PTH2R-201ENST00000272847 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 POM121L14P-201ENST00000406100 1558 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CFAP73A6NFT4 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms