Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 SMARCE1-205ENST00000431889 1569 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
USP15Q9Y4E8 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms