Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ERVW-1Q9UQF0 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVW-1Q9UQF0 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVW-1Q9UQF0 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVW-1Q9UQF0 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVW-1Q9UQF0 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVW-1Q9UQF0 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVW-1Q9UQF0 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVW-1Q9UQF0 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVW-1Q9UQF0 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVW-1Q9UQF0 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVW-1Q9UQF0 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVW-1Q9UQF0 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVW-1Q9UQF0 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ERVW-1Q9UQF0 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVW-1Q9UQF0 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVW-1Q9UQF0 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVW-1Q9UQF0 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVW-1Q9UQF0 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVW-1Q9UQF0 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVW-1Q9UQF0 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVW-1Q9UQF0 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVW-1Q9UQF0 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVW-1Q9UQF0 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVW-1Q9UQF0 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVW-1Q9UQF0 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVW-1Q9UQF0 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVW-1Q9UQF0 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVW-1Q9UQF0 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVW-1Q9UQF0 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVW-1Q9UQF0 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVW-1Q9UQF0 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVW-1Q9UQF0 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVW-1Q9UQF0 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVW-1Q9UQF0 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVW-1Q9UQF0 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVW-1Q9UQF0 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVW-1Q9UQF0 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVW-1Q9UQF0 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ERVW-1Q9UQF0 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms