Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK99

FBXO3, F-box only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO3Q9UK99 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 LINC02083-201ENST00000462835 515 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 AC005954.1-201ENST00000591962 337 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FBXO3Q9UK99 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms