Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APEX2Q9UBZ4 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms