Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CALCOCO1Q9P1Z2 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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