Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CHST12Q9NRB3 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms