Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 AC124068.2-202ENST00000562356 612 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NIFKQ9BYG3 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms