Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 GREB1-206ENST00000396123 5296 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.88
HIGD2AQ9BW72 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 RPS6KA2-211ENST00000510118 5992 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 ZNF283-209ENST00000618787 5713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 TNRC6C-211ENST00000636222 7093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 NPAP1-201ENST00000329468 7526 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 SFMBT2-201ENST00000361972 7922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 THSD7A-205ENST00000617773 10583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 ARAP3-207ENST00000626478 4928 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 SIGLEC1-201ENST00000344754 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 CACNA1F-202ENST00000376251 5813 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
HIGD2AQ9BW72 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms