Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 RAPGEF3-205ENST00000449771 6061 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CDK5RAP3Q96JB5 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms