Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 TUBGCP2-210ENST00000543663 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 RPL27A-201ENST00000314138 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 ARPC5-202ENST00000359856 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 SACS-202ENST00000402364 15134 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 ZAN-207ENST00000620596 8396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 DTL-201ENST00000366991 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 CAMK4-201ENST00000282356 12240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 TUB-202ENST00000305253 6420 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 RPS6KA2-204ENST00000481261 2297 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 ARHGAP21-217ENST00000612832 5514 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 PCSK2-202ENST00000377899 4674 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 PCDHA9-201ENST00000378122 6900 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 TNK2-208ENST00000428187 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 SP3-201ENST00000310015 6359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 ATXN2-226ENST00000608853 4376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 LONRF2-201ENST00000393437 13912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 SPG11-201ENST00000261866 7774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 SRCAP-202ENST00000395059 9126 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 AC010422.6-201ENST00000593682 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 VWA5B1-201ENST00000289815 4475 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 SCN4A-201ENST00000435607 7805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 RAP1GAP-211ENST00000495204 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
COPS9Q8WXC6 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
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