Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 STAM2-201ENST00000263904 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCDC117Q8IWD4 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms