Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

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Length 1,022 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 SLC13A3-205ENST00000417157 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HERC6Q8IVU3 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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