Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 BIRC5-202ENST00000350051 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 EPN2-205ENST00000395626 2863 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 GATA2-201ENST00000341105 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
CCBE1Q6UXH8 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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