Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL7

FNDC7, Fibronectin type III domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC7Q5VTL7 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
FNDC7Q5VTL7 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms