Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 MEGF11-201ENST00000288745 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 SFXN3-201ENST00000224807 3089 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
KLHL12Q53G59 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
KLHL12Q53G59 GAB1-202ENST00000262995 7981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms