Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
SP6Q3SY56 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
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